第30期
皮肤病研究所刘维达教授团队
针对皮肤癣菌基因组学研究
取得新进展
皮肤病研究所真菌科刘维达教授团队基于基因组特点的种系进化进行分析揭示了紫色毛癣菌(T.violaceum)与红色毛癣菌(T.rubrum)临床致病差异，相关研究结果以题为"PhylogenyofdermatophyteswithgenomiccharacterevaluationofclinicallydistinctTrichophytonrubrumandT.violaceum"的研究论文于年2月在线发表于著名真菌研究杂志StudiesinMycology（影响因子14.00）。
红色毛癣菌和紫色毛癣菌是引起皮肤感染的两大主要真菌。临床发现，红色毛癣菌主要感染皮肤和甲，而紫色毛癣菌更易感染头皮和毛发。两者的系统进化特点极为相似，但表型差异较大。阐明红色毛癣菌与紫色毛癣菌的致病差异机理是医学真菌研究的重要问题，具有重大理论及潜在临床应用价值，然而，迄今为止这是一个未解之谜。
在本研究中，刘维达团队占萍博士对红色毛癣菌与紫色毛癣菌进行全基因组测序，并与数据库的皮肤癣菌测序数据进行比照，同时对粘附素与分泌型蛋白酶等致病因子进行预测以及进化分析。结果显示，亲土皮肤癣菌的种间进化差异较显著，亲人和亲动物皮肤癣菌种间进化差异较小；红色毛癣菌与紫色毛癣菌基因序列相似度达99.38%，紫色毛癣菌较红色毛癣菌有更多旁系等位基因。
预测发现，皮肤癣菌存在30个粘附因子相关基因，红色毛癣菌和紫色毛癣菌存在17个粘附因子基因，红色毛癣菌存在4个特异粘附因子基因，紫色毛癣菌存在8个特异粘附因子基因。多基因位点系统计划分析和基因组对比来看，红色毛癣菌与紫色毛癣菌具有高度的亲缘关系。最后文章指出，红色毛癣菌与紫色毛癣菌可能是同一种菌，其表型的差异可能是由于在不同体表位置而表现不同。这是一种崭新的发现，对红色毛癣菌与紫色毛癣菌的认识和研究引入新境界，具有重要的理论指导意义。
刘维达教授团队占萍博士（第一作者）目前工作于医院。阿姆斯特丹大学生物多样性和生态系统动力学研究所G.S.deHoog教授合作参与了该项研究。
该研究获得中国医学科学院医学与健康科技创新工程(-I2M-3-)、国家自然科学基金委的资助()及科技部基础性工作专项(FY）支持。
